普通手术室使用紫外线进行空气消毒，待手术人员进入时紫外线灯必须停止照射，空气污染很快会同升。层流手术室通过层流过滤法能持续不断向室内输送洁净空气来置换手术室内的空气达到净化，以保持手术过程空气质量。因此，层流手术室的动态空气质量明显优于普通手术室。层流手术室布局合理，有合适的平面布置、分区及合理配置辅助用房，层流手术室最大限度地保持无菌清洁环境，防止交叉感染。层流手术室最重要布局是建立专用人流通道和物流通道，物流通道应当洁污分流，不逆流、不交叉，最大限度地保持手术室无菌环境。

层流手术室严格管理和科学使用特别重要，空气净化系统本身不具备杀菌功能，所以层流手术室应有严格的卫生管理制度，并按常规要求做好消毒工作，遵守无菌操作规则。严格人流、物流通道管理，在手术中要尽量减少手术人数和人员流动，分区管理不得交叉使用洁、污通道。接送病人时应用交换车并做好标记，使内外分开，减少污染源带入。常规用的手术消耗材料、药品均在手术间的墙柜中分类放齐放全，麻醉师、护士可以尽量不出门，保证了手术间的密封层流效果。

层流手术室空气净化设备必须坚持日常维护，对洁净区域内的非阻漏式孔板、格栅、丝网等送风口，应当定期进行清洁；对洁净区域内回风口格栅应当使用竖向栅条，每天擦拭清洁1次；对滤料层应按规定期限更换；负压手术室每次手术结束后应当进行负压持续运转15 min后再进行清洁擦拭，达到自净要求方可进行下一个手术。过滤致病气溶胶的排风过滤器应当每半年更换一次；热交换器应当定期进行高压水冲洗，并使用含消毒剂的水进行喷射消毒；对空调器内部加湿器和表冷器下的水盘和水塔，应当定期清除污垢，并进行清洗、消毒；对挡水板应当定期进行清洗；对凝结水的排水点应当定期进行检查，并进行清洁、消毒。