完整的清扫程序如下：

　　（1）准备清洗和消毒（再清洗）溶液，可采用不损坏洁净车间表面面层的普通清洗溶液，某些面层容易受损坏如经不住氧化氢的作用。洁净车间用的溶液应采用去离子水配制，在灭菌生产过程中则采用经过0.22微米过滤器过滤的纯水或注射用水配制。

　　（2）对进入洁净车间进行清扫的人员的要求与进入车间从事工作人员的要求相同。

　　（3）对肉眼可见的污垢（碎玻璃等）应用刷子，簸箕，抹布仔细地清除，不得散布污垢。

　　（4）吊顶：用湿抹布或胶粘滚子清扫吊顶，但要注意不要损坏HEPA过滤器，如果吊顶全部是HEPA过滤器，则不要触动它，以保证通风系统正常工作。必要时可清扫过滤器之间的固定件（边框），用抹布，滚子或吸尘器顺着一个方向依次移动。

　　（5）墙：用墩布，滚子或抹布进行湿法清扫，应平行互相覆盖，自上而下地移动，应特别注意开关，插座和信号装置等。

　　（6）玻璃表面：清扫方式与墙相同，在清扫时洒些许酒精溶液（若是灭菌生产，则要用经0.22微米过滤器过滤的福尔马林溶液）。

　　（7）地坪：清扫方式与墙想同，应平行相互覆盖自中心向门移动，要经常地将海绵放在有溶液的桶中漂洗（可每一次移动后）采用具有海绵夹紧装置的墩布较为方便。

　　（8）要具备灭菌生产条件时，应在完成清扫后再用双氧水蒸汽，福尔马林等对洁净车间内部空间进行灭菌处理，为此可采用双氧水喷雾器或其他工具，应使蒸汽在洁净车间内停留数小时，例如24小时。完成此项消毒后，有时还要对车间个别表面重复消毒。

　　（9）洁净车间清扫完成后，再清扫更衣室，材料气闸室及其中的家具，特别注意洗手盆，水龙头，注液器，及其附近部位。

　　（10）清扫结束后即检查空气和表面洁净度。

　　（11）应在清扫日记上做记录，注明清扫种类，时间和执行者姓名。完成清扫工作后应对洁净车间各表面的洁净度进行检查。