净化车间环境控制的内容包括：空气净化、洁净建筑、与产品直接接触的水或气体或化学品和生产设备、工具器物等污染物的控制以及微振动、噪声、静电的控制、防止等。

　　净化车间各类设备、设施的要进行严格的维护管理，并且制定相应的操作规程，保证各类设备、设施按照要求正常运转，比如包括净化空调系统、各类水气电系统、生产工艺设备和工器具(工装夹具)等。以确保产品的生产工艺要求和空气洁净度等级。

　　厂房排水系统一定要有好的透气装置。净化车间厂房中会有排水设备和重力回水管道，其两者的连接设备一定要有，水封装置最好安装在排出口以下，透气装置一定不能少。

　　净化车间内各类配电盘、柜和进入无尘室的电气管线、管口应密封可靠;净化车间施工流程中还要注意的是顶部，净化车间的顶部通常较高，且大多数都是钢结构框架，净化车间施工流程中顶部先要设计消防、通风、及中央空调的合理安排，因为这些都是净化车间施工中必要的硬件设施，尤其是消防。

　　净化车间设备的材质、加工精度、密闭程度以及管理制度都与交叉污染有关。所以除了合理布局外，提高设备的自动化水平和组成联动的生产线，以减少操作人员，降低人员的活动频率，是防止洁净车间交叉污染的必要措施。