洁净车间机构在设计洁净车间时，除了要注意火灾设备的设施完善，也要注意排水系统的完善，为防止材料残留在管道内，造成微生物以及细菌的滋生，所以排水系统一定要完善。

（1）洁净车间的给水排水干管应布置在技术夹层、技术账井、地沟管槽内，引入洁净室的支管宜暗敷，且给水排水管道穿过洁净室顶棚、墙壁、楼板处应采取可靠的密封措施。

（2）洁净车间机构在设计排水系统应根据排出废水的性质、浓度及水量等进行设计，并应根据不同情况采取废水处理和综合利用措施，且排水主管不应穿过洁净度要求高的净化车间。

（3）建筑物内各种给水管道宜竖向布置，在靠近用水设备附近横向引入，从竖管上引出的支管应尽可能短，一般不宜超过支管直径的6倍，以防水在横管上静止滞留。

（4）洁净车间室内应采用不易积存污物、易于清扫的卫生器具、管材、管架及其附件。同样，阀门选用也以不积液的为好，不宜使用普通截止阀、闸阀，宜使用清洗、消毒方便的旋塞阀、球阀、隔膜阀、卫生蝶阀、卫生截止阀等。

（5）对不允许断水的洁净车间，给水引入管应设置两条，在室内连成环状或贯通枝状双向供水，引入管宜分设于室外环网的不同侧。

（6）洁净室内与回水管道相连的设备、卫生器具和排水设备的排出口以下部位必须设水封装置。

以上就是洁净车间机构如何设置排水管道，除了以上内容管道的连接也要考虑拆洗方便，但不宜采用丝口连接，以避免物料在丝口处沉积，防止水在支管内滞留而滋生细菌。