在防蝇方面，净化工程应在车间设置纱窗、沙门和防蝇风帘以防苍蝇随货物进入车间，有条件的安装灯光诱蝇装置及电动捕蝇装置，防蝇措施的关键就是消除蝇类的滋生源，由于厨房垃圾、食品工厂中的原料残渣、中间产品残渣和制品的废气物，以及原料和制品产生的食品废气物，都是蝇的滋生源，净化工程要将食品下脚料、垃圾放在密闭的垃圾箱内，且保持垃圾箱外壁清洁，同时净化工程要做到工完场清，保存好各类食品原料与成品，及时清除生活垃圾，并进行无害化处理。

　　净化工程防蟑螂主要通过改变环境来实施，消除蟑螂的生活环境，堵塞各种孔、洞、缝，特别是对于水池、热水器周围的孔、洞、缝隙要特别注意，因为这些地方离水源近，温度也较适宜，是最容易滋生蟑螂的地方，在车间、食堂等场所下水道中安置金属丝网，防止蟑螂自下水道侵入，建立严格的物品清扫、洗刷制度，保管好食品和垃圾，不给蟑螂提供生活栖息场所。

　　净化工程防鼠必须采取综合措施，堵死环境中和建筑物内的鼠穴，断绝鼠食来源，对老鼠进入建筑物的通道，如地板下的水道、通风孔、风扇入口、地基下水道口都应设置防鼠网，老鼠几乎无孔不入，因此净化工程要有完备的防鼠设施。