为了达到在通风少的情况下提高室内温湿度场均匀性的目的，ICU净化工程中的普通空调系统常常采用乱流度较大的气流组织形式，以在室内形成较强的二次诱导气流或涡流；而净化空调系统则为保证所要求的洁净度，必须尽量限制和减少尘粒的扩散飞扬，采取各种措施减小二次回流及涡流。

在高级别的ICU净化工程中多采用单向流的气流组织形式。普通空调系统的换气次数常在10h－1以下，而净化空调换气次数远大于普通空调系统，甚至可高达数百次，因此送风量很大，换气次数的差别也导致了净化空调系统的能耗远高于普通空调系统。

洁净ICU净化工程空调冷负荷主要由围护结构传热量、人体散热量、室内照明散热量、室内设备散热量等组成。由于ICU净化工程多位于建筑的内区，围护结构一般采用彩钢板夹保温材料的夹芯板，因此，通过围护结构传热形成的冷负荷较小，人体散热量可按轻度劳动计算，室内照明形成的空调冷负荷可由ICU净化工程照度推算得出，室内设备的散热量因ICU净化工程内用电设备品种、数量及使用频率差异较大而变化较大，需根据实际工程情况进行计算。

一般而言，ICU净化工程总冷负荷约为228～296W／m2，室内湿负荷约为100～120g／（m2·h）。由于净化空调的送风量远大于普通舒适性空调而空调负荷增加并不多，因此送风温差较小，甚至可能只有1～2℃。

洁净ICU净化工程净化空调的空气处理方法主要有一次回风和二次回风两种，GB50333—2002《医院洁净ICU建筑技术规范》（以下简称《规范》）颁布前，多采用新风和回风在净化空调机组的混合段直接混合后再进行各种热湿处理的方式，《规范》颁布后，较多采用新风先经新风机组处理后再进入净化空调机组的方式，大多数设计人员在设计选用新风机组时将新风处理到室内状态等焓点。

当采用一次回风空调系统时，由于冷热抵消，造成的浪费十分严重。二次回风系统避免了夏季再热，是一种节能的空调系统，但其机器露点要低于一次回风系统。

同时，其控制和调节方法比一次回风系统更为复杂。当室内和室外条件发生变化时，很难通过控制一次和二次回风比进行调节。ICU净化工程中，一般对室内有恒温要求的场合，多采用固定比例的一、二次回风，通过调节机器露点来调节含湿量，辅以再热器来调节温度。