进行净化工程的房间，因为其密闭性好，外围护结构对室内影响较小，加之人员、照明及设备的散热，与其他普通空调房间的空调需求不同，过度季节均需要供冷，这就对其冷热源的选择提出了要求。大楼普通中央空调不能完全满足其要求，在净化工程空调系统设计选型时，需考虑其特殊要求进行配置。现通用的主要设计方法有：

（1）采用四管制空调系统，能满足过度季节的供冷要求，净化工程空调主机及热交换器选择与普通病房相同；

（2）夏季采用大楼冷冻机房提供7度冷水，冬季供热站提供60度热水达到平时空调季节要求，另配置风冷螺杆式热泵机组或模块式热泵机组满足过度季节和夜间冷冻机房不运行时空调要求，用电动阀进行切换；

（3）由大楼冷冻机房和换热站提供空调季节冷热水供应，另要求空气处理机组配置直膨式冷热盘管段以作备用，也可采用“一拖一”或“一拖多”变冷媒空调来实现冷热源供给以作备用。从实践来看，三种方式均能满足净化工程场所空调处理的要求，相对而言，前二者处理方法能达到的温湿度控制精度高，但投资较大，运行不灵活，在部分房间运行时，能耗较大；第三种方法相对前二者而言，能达到的温湿度精度较差，但运行灵活，在夜间等部分负荷时运行方便、节能，需考虑室外机放置位置。