1、在了解和熟悉具体设计要求后，就要保质保量的完善施工。这就要求洁净工程施工期间对建设施工各种原材料和机具设备的验收程序严格把关。进场的风管材质必须要符合设计的要求。安装过程的封闭控制和紧固件也要符合规定。洁净壁板除检查平整度和垂直度外，还要注意控制密封状况，其中包括门窗的密封，水电气孔洞的密封等。施工中还要注意防止产生二次污染，施工过程中作业人员的着装和走动以及物料机具的挪动都要实行严格管制。
2、在洁净工程的建设施工前要重视对洁净室设计全方面的掌控，了解设计图的设计意图和具体要求，才能为后续的施工做足准备。所以在此阶段要深刻认识设计的用途和功能，要注意工艺设备与进回风口位置是否相互矛盾，设备是否阻挡风口，影响气流。洁净工程室内地下管线材质、埋设方式与地质情况是否符合。恒温、恒湿间的风流设计，不宜采取风口送回风，会有温湿度不均匀现象。净化等级不同区域人流、物流组织与非净化区域人流、物流组织是否有交叉，有否缓冲措施。工艺设备数量不确定的，空调系统宜预留足够余量。应考虑增加的工艺设备本身散热。关注各种水电预留管线位置、容量与工艺设备的配套。
3、洁净工程室内的墙壁和顶部表面应该表面平滑便于防尘。室内墙壁与墙裙应平齐，尽量减少凹凸面的情况出现，在对墙壁进行抹灰的时候应该采用高级抹灰标准。在同一洁净区域的墙体、墙面和墙顶都要抹面，以减少墙面出现粉化和积尘现象。在室内抹灰时还应该注意洁净室的外墙内侧要有防结露要求，为了防止在抹灰层硬化过程中出现八字裂缝，在洁净工程施工时应在内墙面抹灰层上窗边部位刻意切割若干条竖向细缝，在稳定后再做修补。而与此同时室内抹灰用的水泥都应选用收缩性小的水泥，而且要严格控制水泥的细度和含泥量，从根本上消除墙面开裂和墙面粉化的现象。
4、洁净室的装饰阶段的管理控制也是要注意的，在此阶段要着重控制各种土建施工与动力照明、弱电、给排水等多种工种的交叉工作，其中土建施工包括吊顶、墙面门窗、室内地坪等作业。此时各工序间插、搭、接作业多，流水步距短，扬尘量大，洁净工程施工中不仅要严格遵守工艺流程，还要求装饰施工时满足防尘防静电的要求，以确保洁净室具有良好的气密性。为防止地面因受温度变化或不均匀沉降时引起开裂，生产厂房地面采用钢筋混凝土地坪分二次浇捣，地坪面层与垫层之间设防水涂料隔离层。地坪面层根据不同的使用要求选用PVC及防静电环氧自流平地坪漆。
洁净工程室内的门窗、墙壁、顶棚等和施工缝隙各阴阳角均做成圆弧形，以减少积尘面且便于清洁。
