在洁净工程室内部施工建设完成后，还要考虑到如何让洁净工程室内产生的污浊气体排出的问题，这就牵涉到洁净工程的净化空气系统了，现有洁净室都是通过空调来实现净化空气的。那么净化空调的制作和安装，必须在保证洁净室所需达到的洁净级别的情况下完成。这对净化空调系统的风管制作则更需要精细，风管的制作应该在洁净的环境或相对封闭的环境里进行，地板也应是橡胶地板或其它防护材料，在风管与其它各个部件之间的缝隙应用密封胶密封，风管的管内管外都应该进行彻底的清洗，检测无尘后用薄膜将开口处封闭。制作好的风管在安装时也要注意务必保证风管的连接处严密不漏。在净化空调系统中还离不开过滤器，而高效过滤器的安装必须在洁净工程的内装工程全部完成且空调系统空吹合格后进行。过滤器的外包装不得进入洁净室，而内层的包装须在室内拆开，安装的过程中务必保证滤料的清洁和严密。在洁净工程净化空调系统安装好后，在净化系统调试的时候要注意检测空调系统风量和风压；风口风量与系统风量是否平衡；室内静压差检测等，如检测结果不符合规定，则要通过调整或整改最后达到要求。 

　　在洁净工程建设竣工后需要做的工作则是对项目工程的验收，这也是最重要的一步，洁净工程竣工后验收阶段的工作做不到位就交工，则势必导致在洁净室的应用中产生重大的损失，所以在此阶段一定要做好工程的验收工作，在验收前需要专业的清洁人员把洁净室进行一次彻底的人工清扫，包括所有的死角、阴角、孔槽部位。不易清扫的部位用压缩袋空气吹洗，然后用清洁的白布擦拭。这些工作都应该在常规干燥条件下完成。验收过程对各项指标参数的检测看是否达标，包括风速、风量、压差、洁净度、温湿度、照度、噪声等，严格按照规定验收，如发现不符合设计要求之处应及时处理解决。 

洁净工程的建设施工一定要严格按照设计要求进行，要及时的发现建设施工过程中的问题并及时采取控制措施，把工作细化分工到每一个环节。洁净室对洁净度的要求很高，所以在施工过程中必须加强各阶段的质量控制和洁净管制。