GMP车间净化各操作室必须有足够的面积和空间，以防止因场地拥挤而造成操作上的差错。待验品、合格品和不合格品存放区必须要分开设置，以防因存放混乱而造成生产上的差错。为防止产品交叉污染，对进入GMP车间净化的人和物必须进行净化处理。

　　GMP车间净化与周围的空间必须维持一定的压差，并应按生产工艺的要求决定维持正压差或负压差。在实际GMP车间净化工程中，确定同一洁净区各无尘车间的压差，可以把每个无尘车间的压力与洁净区走廊相比较，以洁净区走廊压力值为基准。确定不同等级洁净区之间的压差，可以先确定低洁净度级别净化车间的正压，再依次提高正压值基数，确定高洁净度级别无尘车间正压。

　　GMP车间净化工程施工中应控制施工作业中的发尘量，特别是吊顶和夹墙内部等隐藏空间，必须随时清扫。

　　在已安装高效过滤器的房间，不能进行有粉尘的装修作业。门窗与内墙而要平直，结构要充分考虑对空气和水汽的密封，使污染粒子不易从外部渗入，防止由于室内外温差而产生结露，车间净化室内不同洁净度房间之间的内让、内窗以及隔断等缝隙均须密封。